Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCLMP48507 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms