Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT3P45378 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT3P45378 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT3P45378 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT3P45378 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNT3P45378 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNNT3P45378 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms