Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms