Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HPCAL1P37235 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPCAL1P37235 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms