Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms