Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms