Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2E1P29083 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2E1P29083 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2E1P29083 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2E1P29083 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2E1P29083 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2E1P29083 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2E1P29083 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2E1P29083 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms