Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD38P28907 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD38P28907 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD38P28907 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD38P28907 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD38P28907 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD38P28907 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD38P28907 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD38P28907 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD38P28907 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms