Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB4P28070 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms