Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSRP1P21291 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms