Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms