Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FAM58BPP0C7Q3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM58BPP0C7Q3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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