Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBP07199 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBP07199 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBP07199 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBP07199 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms