Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THY1P04216 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THY1P04216 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THY1P04216 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THY1P04216 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THY1P04216 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms