Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF2O60811 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF2O60811 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms