Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms