Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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