Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYNGR2O43760 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms