Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODHO43272 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms