Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRPO00591 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRPO00591 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms