Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms