Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4E171 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4E171 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4E171 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms