Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL33A6NCF5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms