Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EFCAB5A4FU69 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB5A4FU69 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms