Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYVE1Q9Y5Y7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYVE1Q9Y5Y7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms