Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX7Q9UNH6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX7Q9UNH6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms