Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms