Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms