Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms