Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms