Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFDP1Q9UEE9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms