Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms