Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EHD3Q9NZN3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms