Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms