Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms