Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NRIP3Q9NQ35 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms