Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms