Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TIMMDC1Q9NPL8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms