Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE41Q9C0J9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms