Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms