Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 ETV7-208ENST00000627426 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS6-204ENST00000380394 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLASP2-201ENST00000313350 1597 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACADSB-202ENST00000368869 1599 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2AJ1-201ENST00000318244 1873 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL13AP17-204ENST00000450028 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 PACRG-AS2-201ENST00000418665 1300 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNRNP40-201ENST00000263694 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIAS-203ENST00000381846 1578 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 FPGT-201ENST00000370894 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 APOBEC3F-202ENST00000381565 616 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02539-201ENST00000411615 737 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 NME6-207ENST00000426689 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL356488.1-201ENST00000429752 609 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006004.1-201ENST00000434887 2145 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms