Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms