Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG6Q9BXT2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms