Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX73

TM2D2, TM2 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2Q9BX73 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TM2D2Q9BX73 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms