Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms