Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR3CQ9BUI4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms