Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC38A2Q96QD8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms