Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms