Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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EP400Q96L91 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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EP400Q96L91 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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EP400Q96L91 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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