Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms